Big Endian and Little Endian
From hpcwiki
El problema se presento debido al formato de maquina con el cual fueron extraídos el cual por defecto es Little Endian, en java el formato que maneja es Big endian lo cual nos generaba los diferentes datos.
Para solucionar esto se leyó byte por byte y se fueron almacenando en un float de la siguiente manera:
float h=ByteBuffer.wrap(Byte[] variable).order(ByteOrder.LITTLE_ENDIAN).getFloat();
con esta linea de código se pudo realizar la lectura correcta del archivo
