View source for HdS:Análisis de datos para la detección de patrones epidemiológicos

'''FUENTES DE DATOS'''

Entre las fuentes de datos a utilizar inicialmente tomaremos las siguientes

* [[Instituto Nacional de Salud]] - No se utiliza por que no se reportan todos los casos
* [[Secretaría de Medio Ambiente]]
* [[Ministerio de Salud y Protección Social]]


'''UBICACIÓN DE DATOS EN EL SERVIDOR'''

Se descargo la información necesaria antes mencionada, para ser almacenadas y ubicadas en el Servidor dispuesto por la Universidad.

Dentro del servidor ubicamos la ruta  '''''../media/hpclab-data/epidemiology/data''''', para cada tipo de dato a utilizar definimos una ubicación específica.

* '''Datos de Salud'''

Para estos datos, utilizamos la carpeta llamada ''INS'', en esta carpeta están los diversos archivos que se pueden descargar de la página del Instituto.

Adicionalmente se ubica en la carpeta, un documento PDF denominado '''''Anexo 1 codificación 2017''''', en cual se relaciona la codificación utilizada por el INS para la recolección de la información a nivel Municipal y la codificación CIE-10 utilizada a nivel mundial.  

Para la investigación en Infección Respiratoria Aguda, se utilizará la información relacionada con el código '''345''' que dentro de los archivos corresponde a la patología '''''ESI - IRAG (VIGILANCIA CENTINELA)'''''. Así mismo en el documento de codificación se identifica como ''Enfermedad Similar a Influenza Infección Respiratoria Aguda Grave (Vigilancia centinela)'', que dentro de la codificación CIE-10 corresponden a los códigos que van desde el J09 al J22.  

* '''Datos ambientales''' 

Para estos datos, utilizamos la carpeta llamada ''climate_data'', en esta carpeta están los diversos archivos que se poseen por cada estación ambiental de cada localidad


'''PROCESAMIENTO DE LA DATA'''

En primera instancia se utiliza la información descargada desde el Cubo OLAP del Ministerio de Salud, se filtra la información referente a Bogotá, para los casos reportados durante los años 2009 a 2016 y pertenecientes a la codificación CIE-10.
 
''Clasificación :'' C10 - ENFERMEDADES DEL SISTEMA RESPIRATORIO.

''Grupos :''         J00-J99 ENFERMEDADES DEL SISTEMA RESPIRATORIO.

''Codificación Seleccionada :''

* J00-J06 INFECCIONES AGUDAS DE LAS VIAS RESPIRATORIAS SUPERIORES.	
* J09-J18 INFLUENZA (GRIPE) Y NEUMONIA.	
* J20-J22 OTRAS INFECCIONES AGUDAS DE LAS VIAS RESPIRATORIAS INFERIORES.	
* J30-J39 OTRAS INFECCIONES AGUDAS DE LAS VIAS RESPIRATORIAS SUPERIORES.